ورود شرکت مکو به کسب‌وکارهای جدید و ضرورت سازماندهی آنها با توجه به تفاوت در ویژگی و استقلال آنها نسبت به کسب‌وکار اصلی (نیروگاهی) را می‌توان از مهم‌ترین دلایل اجرای پروژه بازطراحی ساختار سازمانی شرکت مکو دانست. این پروژه پس از اجرای فعالیت‌های مختلف مطابق با فرآیند طراحی شده (شکل زیر) و اخذ نظرات و تأیید مدیرعامل و اعضاء محترم هیأت مدیره شرکت در دی‌ماه ۱۳۹۹ به اتمام رسید. از مهم‌ترین تغییرات ایجاد شده در ساختار جدید این شرکت، می‌توان به سازماندهی کسب‌وکارهای جدید در مدیریت‌های مختلف و ارائه استقلال در برخی از کارکردها نظیر بازاریابی، ارائه خدمات، مهندسی و تحقیق و توسعه و… اشاره نمود.